為了實現上海市科教興市戰略，上海交通大學與上海第二醫科大學18日正式合併，大陸教育部與上海市政府將從政策與經費投入等方面支持醫學院的發展，組建新上海交通大學醫學院，期盼建設具有國際先進水準的醫學教育和科研基地，而這也是教育部和上海市「部市合作」的具體實踐。

據上海東方早報今天報導，合併後的新上海交通大學直屬於大陸教育部，教育部長周濟表示，兩校合併之後，可發揮上海交大許多學科的綜合優勢，再結合上海第二醫大在醫學領域的專業實力，為學校邁向世界一流大學的目標奠定基礎。